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 Génomique Industrielle 

Les objectifs

La Génomique est l’étude exhaustive et multidisciplinaire des génomes tant en ce qui concerne le nombre que la disposition précise des gènes et leur fonction. Cette science voit se développer actuellement une multitude d’applications dans des domaines aussi variés que le pharmaceutique, la médecine, l’agriculture et les industries qui en dérivent. L’exploitation industrielle des résultats de la Génomique constitue une stratégie de développement dans les différents secteurs d’activités de la biologie avancée. C'est bien plus qu'un master en biologie moléculaire ou un master en génomique qui est proposé : une véritable double formation intensive, en 12 à 15 mois.

Le programme scientifique du Master of Business Engineering en Génomique Industrielle de l’EBI a pour objectif de fournir une formation approfondie traitant des différents concepts de la Biologie Moléculaire classiques et actuels associés aux diverses applications de la génomique : Pharmacogénomique, Diagnostic moléculaire, Transgenèse végétale et animale, Thérapie génique et cellulaire, Protéines recombinantes, puces à  ADN …

C’est grâce à l’association en continu pendant les 6 mois de formation à l’EBI  de ce programme scientifique avec les cours du tronc commun des MBE, que l’étudiant acquiert une vision de chef de projet sur ces problèmes.

Les élèves issus de ce programme ont à la fois la compétence d'un dipplômé de master en biologie moléculaire et cellulaire, mais en plus sont aptes à mettre en place et gérer des missions de recherche appliquée dans des laboratoires publics ou privés, à exploiter les résultats de la génomique dans des PME, à travailler comme responsables d’études en production de molécule en industrie  pharmaceutique.

Ils effectuent le transfert des résultats de la génomique dans les différents secteurs des Bio-industries.

Contenu pédagogique

LA FORMATION

Durant les 6 mois à l’Ecole de Biologie Industrielle, 550 heures de formation sont délivrées (scientifique + tronc commun). L’étudiant est encadré par le professeur permanent responsable du programme, Monsieur ELM SELMI, qui le guide dans la construction et la réalisation de son projet professionnel.

La formation est à la fois axée sur les apprentissages individuels, mais aussi sur le travail en équipe, par projets. Les cours, travaux dirigés, conférences, visites d’entreprises, sont complétés par des travaux pratiques en laboratoire qui constituent des mini-stages de compétences.

LE STAGE

De 6 mois au minimum, dans les entreprises de nos secteurs, avec production d’un mémoire et soutenance devant jury.

Quelques exemples de stages proposés sur cette formation depuis sa création : 

  • Exploration des réponses cellulaires à l’irradiation laser-implication d’une protéine (CEA) 
  • Quantification du PAI-1 actif chez le rat et la souris, Effet de produits inhibiteurs du PAI-1 chez le rat et de l'hypercholestérolémie chez la souris (SERVIER) 
  • Détection de la présence du gène WAP chez les ruminants et le cheval, sous-clonage et étude de sa séquence chez toutes les espèces (INRA- L.M. Houdebine) 
  • Etude de l’implication des métalloprotéases matricielles dans le remodelage de la veine variqueuse (SERVIER) 
  • Développement d’un système d’expression conditionnelle du gène CFTR impliqué dans la mucoviscidose (Institut Mondor de Médecine Moléculaire) 
  • Clonage des récepteurs 7TM GPCR orphelins issus de l’analyse des séquences génomiques (SANOFI-SYNTHELABO)    
  • Etude de l’interaction Beta-caténine/Tcf-4 dans la levure (HYBRIGENICS) 
  • Mise en place et caractérisation d’une banque de lignées cellulaires cancéreuses (HYBRIGENICS),
  • Disease-inducible transgene expression for tailor-made treatment of rheumatoid arthritis (UNIVERSITY MEDICAL CENTER NIJMENGEN PAYS-BAS), AVENTIS PHARMA,   CNG …

DEBOUCHES

Quelques exemples de postes occupés à ce jour par nos étudiants :

  • Cadre scientifique (HYPHEN-BIOMED) 
  • Chef de produit junior (entreprise de kits de diagnostic) 
  • Ingénieur Expression et Ingénierie des Proteines (AVENTIS PHARMA) 
  • plusieurs Chargés de recherche  (SERVIER, HYBRIGENICS)….
  • Deux élèves en PHD au Canada et Pays-Bas.

 Le programme scientifique du MBE en Génomique Industrielle

Environ 350 heures *enseignées

Volumes horaires
(ECTS)

Module 1

Méthodologie de la Génomique structurale et fonctionnelle

Partie théorique : 20 heures
Partie pratique : 40 heures

60 heures

(8)

Module 2

Transgenèse animale et végétale : intérêts en R&D ainsi que les applications industrielles

Conférences  + Stage pratique sur trois journées

 40 heures

(6)

Module 3 

Bio-Puces/DNA & protein chips : Méthodologies et applications

Partie théorique : 10 heures
Partie pratique et étude de cas : Stage sur 2 jours

20 heures

(3)

Module 4

Approche industrielle de la Génomique et Protéomique (cours + stages pratiques)

Pharmacogénomique
De la génomique à la clinique
Diagnostic moléculaire
ADN recombinant
Avec aspects théoriques et stage pratique sur 3 jours

60 heures

(8)

Module 5

Thérapie génique et cellulaire : Développement et production de vecteurs de transfert de gènes associés aux directives normatives

Partie théorique : 30 heures
Partie pratique : 20 heures

50 heures

(6)

Module 6 

Bio-Informatique :

Statistiques, interrogations de banques de données, alignement de séquences, déduction de séquences protéiques, amorces spécifiques.

45 heures

(5)

Module 7

Outils de Management de projet pour les bioindustries et la recherche en biotechnologie :

Outils et Systèmes Qualité, Gestion de projet, Bases de données, Epidémiologie

75 heures

(9)

 *Les nombres d’heures des cours et TP de la formation spécifique sont indicatifs et peuvent être légèrement modifiés, sans toutefois influer sur les équilibres entre enseignements.

Ce Master comporte plusieurs projets, dont :

  • Un projet de Thérapie Génique (Mise en place du protocole et manipulations en laboratoire)  qui donne lieu à l’élaboration d’un poster .
  • Un projet de Génomique : le procédé TAQMAN et DIAGNOSTIC (Mise en place du protocole et manipulations en laboratoire)  qui donne lieu à l’élaboration d’un article en Anglais

Environ 100 heures de travail personnel et en groupes

 

Partenaires

  • Institut Cochin,
  • Institut Mondor de Médecine Moléculaire,
  • ALCIMED,
  • CEA-IRSN,
  • CEA-Saclay,
  • GSK,
  • CIBA-CORNING,
  • GENETHON,
  • Centre National de Génotypage,
  • GENSET,
  • BIOMERIEUX,
  • BIORAD,
  • SANOFI-SYNTHELABO,
  • QIAGEN,
  • AVENTIS Evry et Vitry,
  • GENOLIFE,
  • SERVIER,
  • HYBRIGENICS,
  •  IDM,
  • CHU ST ANTOINE,
  • LTCRA,
  • Institut PASTEUR,
  • UROGENE, 
  • SOFINNOVA Partners,
  • APPLIED BIOSYSTEMS,
  • NATEXIS CAPITAL …

Contacts

Responsable scientifique et pédagogique
Pr Abdellatif ELM SELMI, PhD
e-mail : a.elmselmi@ebi-edu.com

Secrétariat admissions 
Valérie ROQUES 
EBI
32 Bd du Port
95094 Cergy-Pontoise cedex
Tel : 01.30.75.62.46
Fax : 01.30.75.62.51
e-mail :
v.roques@ebi-edu.com

Témoignages

Le stage de fin d'études que j'ai effectué chez SERVIER m'a permis de me rendre compte que la recherche fondamentale (pré-clinique) n'était pas ce que je préférais. Je me suis donc dirigée vers la recherche clinique et en suis très satisfaite. La spécialisation scientifique de ce master en génomique, biologie moléculaire et cellulaire me sert beaucoup car je travaille sur les recherches en cancérologie et un grand nombre  de nos cours y était consacrés. Concernant ce que nous avons appris en gestion de l'entreprise, cela est utile pour progresser vers des fonctions d'encadrement.
 
Michèle TORRES
Master génomique EBI - Master of Business Engineering promotion 3
Attachée de recherche clinique FNCLCC
 
 
Ma formation de master génomique à l'EBI bien mise en valeur et complétée par un bon stage m'a permis de décrocher 2 emplois potentiels en même temps!
L'un qui est une thèse en industrie que je poursuis actuellement et l'autre un poste de chef de projet et ce, alors que j'étais encore en satge de fin de MBE. De plus, j'ai su par la suite que c'était justement cette formation qui avait fortement intéressé le recruteur dans le domaine de l'immunologie.
 
Eric WAMBRE
Master génomique EBI - Master of Business Engineering promotion 3
Assistant de recherche.  (Doctorant) STALLERGENES